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Enregistrement W2143616949 · doi:10.1093/gbe/evr034

Correlated Evolution among Six Gene Families in Drosophila Revealed by Parallel Change of Gene Numbers

2011· article· en· W2143616949 sur OpenAlexaff
Dong‐Dong Wu, David M. Irwin, Ya‐Ping Zhang

Notice bibliographique

RevueGenome Biology and Evolution · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensDiabetes CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Eye Institute
Mots-clésBiologyGeneRepertoireGeneticsDrosophila melanogasterDrosophila (subgenus)Phylogenetic treeGene familyEvolutionary biologyAdaptation (eye)Molecular evolutionGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteins involved in a pathway are likely to evolve in a correlated fashion, and coevolving gene families tend to undergo complementary gains and losses. Accordingly, gene copy numbers (i.e., repertoire size) tend to show parallel changes during the evolution of coevolving gene families. To test and verify this hypothesis, here we describe positive correlations among the repertoire sizes of six gene families, that is, trypsin-like serine protease, odorant-binding protein, odorant receptor, gustatory receptor, cytochrome P450, and glutathione S-transferase after excluding the possibility of phylogenetic constraint and random drift. The observed correlations are indicative of parallel changes in the repertoire sizes of the six gene families that are due to similar demands for the quantity of these different genes in different lineages of Drosophila. In conclusion, we propose that the correlated evolution among these six gene families in Drosophila is a signature of a parallel response to ecological adaptation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,292
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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