Variations in Reverse Transcriptase and RNase H Domain Mutations in Human Immunodeficiency Virus Type 1 Clinical Isolates Are Associated with Divergent Phenotypic Resistance to Zidovudine
Notice bibliographique
Résumé
Mutations in the RNase H domain of human immunodeficiency virus type 1 RT have been reported to cause resistance to zidovudine (ZDV) in vitro. However, very limited data on the in vivo relevance of these mutations in patients exist to date. This study was designed to determine the relationship between mutations in the RNase H domain and viral susceptibility to nucleoside analogues. Viruses harboring complex thymidine analogue mutation (TAM) and nucleoside analogue mutation (NAM) profiles were evaluated for their phenotypic susceptibilities to ZDV, tenofovir (TNF), and the nonapproved nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) beta-2',3'-didehydro-2',3'-dideoxy-5-fluorocytidine (Reverset), beta-D-5-fluorodioxolane-cytosine, and apricitabine. As controls, viruses from NRTI-naïve patients were also studied. The pol RT region (codons 21 to 250) of the viruses were sequenced and evaluated for mutations in the RNase H domain (codons 441 to 560) and the connection domain (codons 289 to 400). The results showed that viruses from patients failing multiple NRTI-containing regimens had distinct TAM and NAM profiles that conferred various degrees of resistance to ZDV (0.9- to >300-fold). Sequencing of the RNase H domain identified five positions (positions 460,468, 483, 512, and 519) at which extensive amino acid polymorphisms common in both wild-type viruses and viruses from treated patients were identified. No mutations were observed at positions 539 and 549, which have previously been associated with ZDV resistance. Mutations in the RNase H domain did not appear to correlate with the levels of phenotypic resistance to ZDV. Although some mutations were also observed in the connection domain, the simultaneous presence of the L74V and M184V mutations was the most significant determinant of phenotypic resistance to ZDV in patients infected with viruses with TAMs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».