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Enregistrement W2143669642 · doi:10.11646/zootaxa.3784.1.2

DNA barcoding of Vietnamese bent-toed geckos (Squamata: Gekkonidae: Cyrtodactylus) and the description of a new species

2014· article· en· W2143669642 sur OpenAlexaff
Sang Ngoc Nguyen, Junxiao Yang, Thanh-Ngan Thi Le, Luan Thanh Nguyen, Nikolai L. Orlov, Truong Quang Nguyen, Jie‐Qiong Jin, Dingqi Rao, Thao Ngoc Hoang, Jing Che, Robert W. Murphy, Ya‐Ping Zhang

Notice bibliographique

RevueZootaxa · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAmphibian and Reptile Biology
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGekkonidaeBiologyGeckoSquamataDNA barcodingGenetic divergenceZoologyRange (aeronautics)Evolutionary biologyGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Species of bent-toed gecko (Cyrtodactylus) in Vietnam have been described at a rate of nearly four species per year since 2007 mostly based on morphological data. A tool that guides species delimitation will accelerate the rate of documentation, and at a time when the recognition of species greatly benefits conservation. We use DNA barcoding using COI (550 bp) to re-examine the levels of genetic divergence and taxonomic status of 21 described species of Vietnamese bent-toed geckos. Tree-based analyses resolve all sampled species and identify potential undescribed taxa. Kimura 2-parameter genetic distances between the described species average 21.0±4.2% and range from 4.3% to 28.7%. Further, our analyses discover two potentially new species from Vietnam, two from Laos and one from China. Herein we describe the new species Cyrtodactylus puhuensis sp. nov. from Vietnam on the basis of both genetics and morphology. Genetically, it differs from the remaining species by an average K2P distance of 24.0±1.8%. Morphologically, the new species is diagnosed by its medium-size (snout-vent length 79.24 mm and tail length 82.59 mm, for the single known individual), in having a series of moderately enlarged transverse subcaudals and a series of moderately enlarged femoral scales that extend from precloacal scales, in possessing femoral scales without pores, with males having five precloacal pores, and in exhibiting 8 supralabials, 10 infralabials, 23 narrow subdigital lamellae on its fourth toe, and 36 transverse ventrals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,466
Score d'incertitude au seuil0,895

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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