Measurement of islet cell antibodies in the Type 1 Diabetes Genetics Consortium: efforts to harmonize procedures among the laboratories
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: and PURPOSE: Three network laboratories measured antibodies to islet autoantigens. Antibodies to glutamic acid decarboxylase (GAD65 [GADA]) and the intracellular portion of protein tyrosine phosphatase (IA-2(ic) [IA-2A]) were measured by similar, but not identical, methods in samples from participants in the Type 1 Diabetes Genetics Consortium (T1DGC). METHODS: All laboratories used radiobinding assays to detect antibodies to in vitro transcribed and translated antigen, but with different local standards, calibrated against the World Health Organization (WHO) reference reagent. Using a common method to calculate WHO units/mL, we compared results reported on samples included in the Diabetes Autoantibody Standardization Program (DASP), and developed standard methods for reporting in WHO units/mL. We evaluated intra-assay and inter-assay coefficient of variation (CV) in blind duplicate samples and assay comparability in four DASP workshops. RESULTS: Values were linearly related in the three laboratories for both GADA and IA-2A, and intra-assay technical errors for values within the standard curve were below 13% for GADA and below 8.5% for IA-2A. Correlations in samples tested 1-2 years apart were >97%. Over the course of the study, internal CVs were 10-20% with one exception, and the laboratories concordantly called samples GADA or IA-2A positive or negative in 96.7% and 99.6% of duplicates within the standard curve. Despite acceptable CVs and general concordance in ranking samples, the laboratories differed markedly in absolute values for GADA and IA-2A reported in WHO units/mL in DASP over a large range of values. LIMITATIONS: With three laboratories using different assay methods (including calibrators), consistent values among them could not be attained. CONCLUSIONS: Modifications in the assays are needed to improve comparability of results expressed as WHO units/mL across laboratories. It will be essential to retain high intra- and inter-assay precision, sensitivity and specificity and to confirm the accuracy of harmonized methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».