Conformational analysis in aqueous solution and estimation of the persistence length of exopolysaccharides produced by <i>Lactobacillus helveticus</i> Lh59 and <i>Streptococcus macedonicus</i> Sc136
Notice bibliographique
Résumé
The conformations of two exopolysaccharides, one produced by Lactobacillus helveticus Lh59 and one by Streptococcus macedonicus Sc136, were investigated by molecular modelling to get insight into their physical properties. In particular, the influence of side chains and glycosidic linkage types on the overall shapes and persistence lengths of the polysaccharides were studied. It appeared that the side chains had only minor effects on the persistence lengths of the polysaccharides, with the exception of the monosaccharide residue directly attached to the backbone. The extensiveness of the backbone is enhanced by β-D-Hexp-(1→4) structural elements, whereas α-D-Hexp-(1→3) and α-D-Hexp-(1→4) elements create structural variability by introducing bends. The occurrence of either (1→5)- or (1→6)-linked monosaccharides, resulting in one extra bond between monosaccharide units, causes the overall flexibility of the polysaccharide chain to be enhanced and extensiveness to be reduced. The presence of such flexible linkages in the backbone leads to a shorter persistence length than when present in the side chain: a value of only 4.5 nm was found for the L. helveticus Lh59 EPS with a (1→5) linkage in the backbone, and a value of 8.5 nm for the S. macedonicus Sc136 EPS with two (1→6) linkages in the side chain.Key words: conformational analysis, exopolysaccharide, Lactobacillus helveticus, molecular modelling, persistence length, Streptococcus macedonicus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».