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Enregistrement W2143764479 · doi:10.1525/auk.2011.10149

Population Genetics and Effective Population Size of the Critically Endangered Nihoa Millerbird (<i>Acrocephalus Familiaris Kingi</i>)

2011· article· en· W2143764479 sur OpenAlexaff
Jason A. Addison, Antony W. Diamond

Notice bibliographique

RevueThe Auk · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesU.S. Fish and Wildlife Service
Mots-clésBiologyInbreedingGenetic diversityEffective population sizeMicrosatellitePopulationEvolutionary biologyConservation geneticsGenetic monitoringPasserineZoologyEcologyGeneticsAlleleGenetic variationDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many species endemic to isolated islands are of conservation interest because of concerns over the potentially devastating effects of environmental stochasticity and the pending threat of anthropogenic influences and invasive species. The effective size (Ne) of these species is a key parameter in their conservation because it predicts the detrimental effects of inbreeding or genetic drift and can be used to inform management plans. We used microsatellite allele frequencies (4 loci) and mtDNA (control region; cytochrome b) sequences to assess the genetic diversity and the effective number of breeders (Nb) in the Nihoa Millerbird (Acrocephalus familiaris kingi), a critically endangered passerine endemic to the northwest Hawaiian island of Nihoa. Using samples collected in 2007 and 2009, our results reveal extremely low levels of genetic diversity at both microsatellites and mtDNA, and both approximate Bayesian computation (ABC) and sibship methods indicate that the effective number of breeders (Nb) for this species is between 5 and 13 individuals. Our analysis highlights the utility of ABC and sibship methods for estimating Ne in species with low genetic polymorphism or few loci. We compare our results to a recent genetic study of this species and document the loss of alleles at two microsatellite loci and one unique mtDNA haplotype. We discuss our findings in the context of the planned translocation of Nihoa Millerbirds from Nihoa to Laysan Island.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,319

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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