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Enregistrement W2143860256 · doi:10.1128/cvi.00068-11

Serological Response of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Type III Secreted Proteins in Sera from Vaccinated Rabbits, Naturally Infected Cattle, and Humans

2011· article· en· W2143860256 sur OpenAlexafffund
David J. Asper, Mohamed A. Karmali, Hugh G.G. Townsend, Dragan Rogan, Andrew Potter

Notice bibliographique

RevueClinical and Vaccine Immunology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyMicrobiologyEscherichia coliEffectorSerologyEnterobacteriaceaeSerotypePathogenSecretionPathogenicity islandWestern blotShiga toxinVirologyAntibodyGeneImmunologyGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Escherichia coli O157:H7 is an important zoonotic pathogen, causing hemolytic uremic syndrome (HUS). The colonization of cattle and human hosts is mediated through the action of effectors secreted via a type III secretion system (T3SS). The structural genes for the T3SS and many of the secreted effectors are located on a pathogenicity island called the locus of enterocyte effacement (LEE). We cloned and expressed the genes coding for 66 effectors and purified each to measure the cross-reactivity of type III secreted proteins from Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) serotypes. These included 37 LEE-encoded proteins and 29 non-LEE effectors. The serological response against each protein was measured by Western blot analysis and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) using sera from rabbits immunized with type III secreted proteins (T3SPs) from four STEC serotypes, experimentally infected cattle, and human sera from six HUS patients. Twenty proteins were recognized by at least one of the STEC T3SP-vaccinated rabbits by Western blotting. Several structural proteins (EspA, EspB, and EspD) and a number of effectors (Tir, NleA, and TccP) were recognized by O26-, O103-, O111-, and O157-specific sera. Sera from experimentally infected cattle and HUS patients were tested using an ELISA against each of the proteins. Tir, EspB, EspD, EspA, and NleA were recognized by the majority of the samples tested. A number of other proteins also were recognized by individual serum samples. Overall, proteins such as Tir, EspB, EspD, NleA, and EspA were highly immunogenic in vaccinated and naturally infected subjects and could be candidates for a cross-protective STEC vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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