Preliminary examination of time-resolved fluorometry for protein array applications
Notice bibliographique
Résumé
The advantages of time-resolved fluorometry over conventional fluorometric analysis are well known. However, time-resolved fluorescence has not as yet found wide applications in protein microarray or other multiparametric methods of analysis. Here we describe a general method which is suitable for multiparametric and microarray analysis, based on time-resolved fluorometry. A polystyrene surface is coated with different monoclonal antibodies, specific for certain analytes. The analyte mixtures are then universally biotinylated, using an active biotin ester. After removing excess biotin, the biotinylated samples are applied on the polystyrene surface, incubated and the excess is washed away. The bound moieties are then quantified by adding a universal detection reagent containing streptavidin, labelled with a fluorescent europium chelate. After washing and drying of the solid surface, the immobilized moieties are detected by using solid-phase, laser-excited time-resolved fluorometric analysis. In a preliminary examination of this principle, we have demonstrated that we can correctly identify upregulation of three secreted proteins, following stimulation of a breast carcinoma cell line with various steroids. Our method should be suitable for high-density microarray analysis of proteins, captured by specific monoclonal antibodies or other binding reagents.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».