Analysis of Acid Sphingomyelinase Activity in Dried Blood Spots Using Tandem Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Niemann Pick disease (NP) is a rare, lysosomal storage disorder due to deficiency of the intra-lysosomal enzyme acid sphingomyelinase (ASM) resulting in intracellular accumulation of sphingomyelin. We evaluated a tandem mass spectrometry (MS/MS) method to analyze ASM activity in dried blood spots (DBS) that may be suitable for laboratory diagnosis of NP including high throughput screening of at-risk populations and potentially for newborn screening. METHODS: ASM activity was measured in 3.2 mm punches from DBS. The eluate was incubated with the ASM substrate (N-Hexanoyl-D-erythro-sphingosylphosphorylcholine [C6-sphingomyelin (C(29)H(59)N(2)O(6)P)]) and an internal standard (N-butyroyl-D-erythro-sphingosine [C4-ceramide (C(22)H(43)NO(3))]). ASM product and IS were analyzed using MS/MS in multiple reaction monitoring mode for transitions m/z 370.6>264.3 (ASM internal standard) and m/z 398.6>264.3 (ASM product). RESULTS: ASM activities were stable for up to 2 months at or below 4℃. Position of the punch in the DBS and/or hematocrit of the DBS had a limited effect on ASM activities. Both intra- and inter-assay variability were below 10%. There was no carry-over. The median ASM activity in 2,085 newborn infants was 9.5 µmol/h/L (mean 10.6) with a SD of 5.06 µmol/h/L. Six of 2,085 (0.3%) infants were found to have ASM activities below the cut-off of 2.5 µmol/h/L. ASM activities were below the cut-off level in all 10 previously diagnosed cases with NP (range: 0.16 to 2.08 µmol/h/L). CONCLUSIONS: This MS/MS method for the measurement of ASM activity in DBS is robust and suitable for laboratory diagnosis of NP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».