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Enregistrement W2143901143 · doi:10.3343/alm.2012.32.5.319

Analysis of Acid Sphingomyelinase Activity in Dried Blood Spots Using Tandem Mass Spectrometry

2012· article· en· W2143901143 sur OpenAlexaff
Elisa Legnini, Joe Orsini, Adolf Mühl, Britt Johnson, Angéla Dajnoki, Olaf A. Bodamer

Notice bibliographique

RevueAnnals of Laboratory Medicine · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAcid sphingomyelinaseTandem mass spectrometrySphingomyelinDried blood spotChemistryDried bloodSpotsCeramideNewborn screeningSphingomyelin phosphodiesteraseChromatographySelected reaction monitoringSphingosineMass spectrometryBiochemistryCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Niemann Pick disease (NP) is a rare, lysosomal storage disorder due to deficiency of the intra-lysosomal enzyme acid sphingomyelinase (ASM) resulting in intracellular accumulation of sphingomyelin. We evaluated a tandem mass spectrometry (MS/MS) method to analyze ASM activity in dried blood spots (DBS) that may be suitable for laboratory diagnosis of NP including high throughput screening of at-risk populations and potentially for newborn screening. METHODS: ASM activity was measured in 3.2 mm punches from DBS. The eluate was incubated with the ASM substrate (N-Hexanoyl-D-erythro-sphingosylphosphorylcholine [C6-sphingomyelin (C(29)H(59)N(2)O(6)P)]) and an internal standard (N-butyroyl-D-erythro-sphingosine [C4-ceramide (C(22)H(43)NO(3))]). ASM product and IS were analyzed using MS/MS in multiple reaction monitoring mode for transitions m/z 370.6>264.3 (ASM internal standard) and m/z 398.6>264.3 (ASM product). RESULTS: ASM activities were stable for up to 2 months at or below 4℃. Position of the punch in the DBS and/or hematocrit of the DBS had a limited effect on ASM activities. Both intra- and inter-assay variability were below 10%. There was no carry-over. The median ASM activity in 2,085 newborn infants was 9.5 µmol/h/L (mean 10.6) with a SD of 5.06 µmol/h/L. Six of 2,085 (0.3%) infants were found to have ASM activities below the cut-off of 2.5 µmol/h/L. ASM activities were below the cut-off level in all 10 previously diagnosed cases with NP (range: 0.16 to 2.08 µmol/h/L). CONCLUSIONS: This MS/MS method for the measurement of ASM activity in DBS is robust and suitable for laboratory diagnosis of NP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,126
Score d'incertitude au seuil0,814

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,007
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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