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Enregistrement W2144196567 · doi:10.1183/09031936.00058911

Interferon release does not add discriminatory value to smear-negative HIV–tuberculosis algorithms

2011· article· en· W2144196567 sur OpenAlexafffund
Molebogeng X. Rangaka, Hannah P. Gideon, Katalin A. Wilkinson, Madhukar Pai, Judith Mwansa-Kambafwile, Gary Maartens, Judith R. Glynn, Andrew Boulle, Katherine Fielding, René Goliath, R. Titus, Shaheed Mathee, Robert J. Wilkinson

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchWellcome Trust
Mots-clésMedicineTuberculosisInternal medicineLogistic regressionTuberculinAlgorithmReceiver operating characteristicSputumTuberculosis diagnosisIsoniazidQuantiFERONGastroenterologyImmunologyMycobacterium tuberculosisPathologyLatent tuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical algorithms for evaluating HIV-infected individuals for tuberculosis (TB) prior to isoniazid preventive therapy (IPT) perform poorly, and interferon-γ release assays (IGRAs) have moderate accuracy for active TB. It is unclear whether, when used as adjunct tests, IGRAs add any clinical discriminatory value for active TB diagnosis in the pre-IPT assessment. 779 sputum smear-negative HIV-infected persons, established on or about to commence combined antiretroviral therapy (ART), were screened for TB prior to IPT. Stepwise multivariable logistic regression was used to develop clinical prediction models. The discriminatory ability was assessed by receiver operator characteristic area under the curve (AUC). QuantiFERON-TB Gold in-tube (QFT-GIT) was evaluated. The prevalence of smear-negative TB by culture was 6.4% (95% CI 4.9-8.4%). Used alone, QFT-GIT and the tuberculin skin test (TST) had comparable performance; the post-test probability of disease based on single negative tests was 3-4%. In a multivariable model, the QFT-GIT test did not improve the ability of a clinical algorithm, which included not taking ART, weight <60 kg, no prior history of TB, any one positive TB symptom/sign (cough ≥ 2 weeks) and CD4+ count <250 cells per mm(3), to discriminate smear-negative culture-positive and -negative TB (72% to 74%; AUC comparison p=0.33). The TST marginally improved the discriminatory ability of the clinical model (to 77%, AUC comparison p=0.04). QFT-GIT does not improve the discriminatory ability of current TB screening clinical algorithms used to evaluate HIV-infected individuals for TB ahead of preventive therapy. Evaluation of new TB diagnostics for clinical relevance should follow a multivariable process that goes beyond test accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,062
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,141
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0620,141
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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