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Enregistrement W2144251250 · doi:10.1094/pdis-94-4-0484c

First Report of <i>Impatiens necrotic spot virus</i> on Spiderlily in China

2010· article· en· W2144251250 sur OpenAlexaboutno aff
Y. T. Liu, Yongjie Zheng, Yating Li, Zongying Li

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImpatiensBiologyPlant virusOrnamental plantGenBankVirologyBalsaminaceaeSpotsTospovirusRNA virusBotanyVirusRNAGeneGeneticsCultivarTomato spotted wilt virus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Impatiens necrotic spot virus (INSV) (genus Tospovirus; family Bunyaviridae) is a devastating disease in the production of ornamental flowers (1). From 2007 to 2009, a survey of 10 major parks and recreation areas in Kunming, the capital of Yunnan Province, China, indicated that approximately 60 to 70% of Spiderlily (Hymenocallis littoralis Salisb.) plants from eight parks had symptoms of concentric ring spots and necrotic spots. Symptomatic plants were tested for INSV and Tomato spotted wilt virus (TSWV) with an immunostrip (Agdia Inc. Elkhart, IN). Results indicated that only the samples designated HDL were positive for INSV and all other samples were negative for both INSV and TSWV. Mechanically inoculated Emilia sonchifolia, Nicotiana glutinosa, Impatiens balsamina, and N. rustica showed chlorotic lesions, concentric rings, and severe necrosis, symptoms typical for INSV in these hosts. Electron microscope inspection found tospovirus-like spheroidal, enveloped particles that were 90 nm in diameter. Primer 5 software (Premier, Canada) was used to design 14 primers from GenBank Accession No. NC_003625 to amplify the L RNA, nine from NC_003616 to amplify the M RNA, and six from NC_003624 to amplify the S RNA. With total RNA extracted from infected plant tissue as templates in reverse transcription (RT)-PCR, these primers generated 29 target fragments of 250 to 900 bp. These fragments were cloned with the vector pMD19 simple-T vector (Takara Bio Inc., Dalian, China) and sequenced. The sequences of the clones were aligned with the software DNAman (version 2.5; Lynnon Biosoft, Quebec, Canada), showing that RNAs L, M, and S are 8,776 bp (GenBank Accession No. GU112505), 4,948 bp (GenBank Accession No. GU112503), and 2,875 bp (GenBank Accession No. GU112504), respectively. BLAST analysis of these Spiderlily INSV sequences against the NCBI sequence database indicated that the RdRp protein (L RNA) was 99.6% identical with the RdRp protein from an Italian isolate (No. DQ425094), the Nsm protein (M RNA) has 99.0% identity with the Nsm protein from an isolate from Italy (No. DQ425095) and one from the United States (No. NC_003616), the G1G2 polyprotein (M RNA) has 99.9% identity with the analogous protein from an Italian isolate (No. DQ425095), the N protein (S RNA) has 99.6% identity with the N protein from an Italian isolate (No. DQ425096), and the NSs protein (S RNA) has 98.7% identity with the NSs protein from an isolate from Japan (No. AB109100). To our knowledge, this is the first report of INSV on Spiderlily in China. Reference: (1) A. E. Whitfield et al. Annu. Rev. Phytopathol. 43:459, 2005.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,666
Score d'incertitude au seuil0,467

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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