Black spruce (<i>Picea mariana</i>) foliage hosts numerous and potentially endemic fungal endophytes
Notice bibliographique
Résumé
Fungal foliar endophytes (hereinafter endophytes) were isolated on malt agar from black spruce ( Picea mariana (Mill.) BSP) needles from the Quebec boreal forest during 2 successive years to study their distribution along a latitudinal transect. Twenty sites were sampled in 2002, 8 of which were sampled again in 2003, in an area located between 47°N and 54°N in the province of Quebec. The endophytes were named whenever possible, using homologies of ITS rDNA sequences from GenBank. In 2002, 232 morphotypes were classified in 40 operational taxonomic units (OTUs), and in 2003, 93 morphotypes were classified in 16 OTUs, for a total of 44 OTUs. Isolation frequencies of the most common endophyte species were 28% for Lophodermium piceae (Fuchel) Höhn., 17% for Darkera parca Whitney, Reid & Piroz, and 9% for Dwayaangam colodena Sokolski & Bérubé. Of the 44 OTUs identified, 18 were unique to P. mariana and found on one site only, possibly constituting rare endemic species. There was some evidence that needles colonized with rare endophyte species were more abundant in the western and southern regions than in the northern region. This supports our hypothesis that as the diversity of tree species surrounding the P. mariana decrease from the southern region to the northern region, the diversity of endophytes also decreases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».