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Enregistrement W2144317189 · doi:10.1002/mds.23853

The curious case of phenocopies in families with genetic Parkinson's disease

2011· review· en· W2144317189 sur OpenAlexafffund
Christine Klein, Rosalind Chuang, Connie Marras, Anthony E. Lang

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2011
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPhenocopyPenetranceGeneticsLRRK2ParkinsonismPedigree chartParkinDiseaseParkinson's diseaseDementiaBiologyMutationMedicineInternal medicinePhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Monogenic forms of Parkinson's disease account for ∼3% of all "idiopathic" Parkinson's disease. With reduced penetrance in dominant forms and manifesting heterozygotes in recessive forms of Parkinson's disease, it has been well recognized that inheritance patterns do not always follow classic Mendelian genetics. A novel twist to the puzzle is the presence of phenocopies (i.e., family members with the same clinical syndrome as the mutation carriers, but lacking the familial mutation). We reviewed all pedigrees published between 1997 and 2009 with α-synuclein, leucine-rich repeat kinase 2, Parkin, or PTEN-induced kinase 1 mutations with at least 2 affected individuals and known genetic status for the possible presence of phenocopies. Of 537 patients with clinical Parkinson's disease in 160 families meeting our inclusion criteria, 27 patients (5.0%) from 23 families (14.4%) were phenocopies. Phenocopies represented 3.8% of all blood relatives reported in the pedigrees containing phenocopies and an estimated 1.3% of all blood relatives in all pedigrees included. Both of these rates exceeded age-specific prevalences of Parkinson's disease. In 4 families, the phenocopy was explained by another known mutation: In 2 pedigrees, a monogenic cause was likely; in another 2, secondary parkinsonism was suspected; and in the remaining 15 families, "sporadic Parkinson's disease" was suggested as the cause of disease in the phenocopy. The unexpectedly high number of phenocopies of mostly unknown origin within families with a seemingly known etiology of Parkinson's disease adds another level of complexity to genetic research of Parkinson's disease, as well as to the interpretation of genetic testing results in the clinical diagnostic setting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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