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Enregistrement W2144322202 · doi:10.1139/g03-064

Some morphological, growth, and genomic properties of human cells chronically infected with porcine endogenous retrovirus (PERV)

2003· article· en· W2144322202 sur OpenAlexvenueno aff
Ruhul Kuddus, Chandrashekhar R. Gandhi, Khaja K. Rehman, Fengli Guo, L A Valdivia, John J. Fung

Notice bibliographique

RevueGenome · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueXenotransplantation and immune response
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEndogenous retrovirusRetrovirusVirologyLong terminal repeatMolecular biologygenomic DNAGenomeDNASouthern blotGeneEndogenyHEK 293 cellsCell cultureGeneticsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A major concern in using porcine organs for transplantation is the potential of transmission of porcine endogenous retrovirus (PERV). To investigate the long-term effects of PERV infection on human cells, human embryonic kidney cell line HEK-293 infected with PERV PK-15 was maintained for up to 72 passages and samples were harvested at intervals for use in morphological, growth, and genomic analyses. Morphology, DNA content/cell, and doubling time of uninfected and infected cells were similar. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of PCR-amplified nearly full-length PERV genome showed no alterations in band pattern. RFLP analysis of the long terminal repeats (LTR) showed some changes in band pattern, but not in length. Southern blot analysis of genomic DNA of infected cells indicated random integration of PERV without structural alterations in proviral genome. Semi-quantitative PCR demonstrated a gradual increase of proviral load in the infected cells. Sequence analysis of the LTR region of PERV from infected cells indicated a relatively low rate (6.0 x 10(-4)/bp or about 2 x 10(-6)/bp/generation) of mutation. There were also indications of recombination of PERV strains A and B. Finally, PERV infection had no effect on transcription of human endogenous retrovirus-K (HERV-K) genes. Together, no significant effect attributable to PERV infection was evident on chronically PERV-infected HEK-293 cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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