MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2144365936 · doi:10.1002/jobm.200800007

Metabolic adaptation and oxaloacetate homeostasis in <i>P. fluorescens </i> exposed to aluminum toxicity

2008· article· en· W2144365936 sur OpenAlexafffund
Joseph Lemire, Puja Kumar, Ryan J. Mailloux, Kathyrn Cossar, Vasu D. Appanna

Notice bibliographique

RevueJournal of Basic Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAluminum toxicity and tolerance in plants and animals
Établissements canadiensLaurentian University
Organismes subventionnairesOntario Centres of Excellence
Mots-clésCitrate synthasePhosphoenolpyruvate carboxykinasePseudomonas fluorescensPhosphoenolpyruvate carboxylasePyruvate carboxylaseBiochemistryPyruvate kinaseEnzymeChemistryBiologyGlycolysisBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microbial systems are known to elaborate intricate metabolic strategies in an effort to fend the toxic impact of numerous metals. In this study, we show that the exposure of Pseudomonas fluorescens to aluminum (Al) resulted in a metabolic shift aimed at diverting oxaloacetate towards the biogenesis of an aluminophore. This metabolic alteration was characterized by uncoupling of two gluconeogenic enzymes, namely pyruvate carboxylase (PC) and phosphoenolpyruvate carboxykinase (PEPCK). While PC displayed a sharp increase in activity and expression, PEPCK was severely diminished. Malic enzyme (ME) and NAD kinase (NADK), two enzymes involved in maintaining a reductive environment, were markedly increased in the Al-stressed cells. Hence, Al-exposed Pseudomonas fluorescens evoked a metabolic response aimed at generating oxaloacetate and promoting an intracellular reductive environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Basic MicrobiologyMême sujetAluminum toxicity and tolerance in plants and animalsTravaux en français237 207