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Enregistrement W2144480372 · doi:10.1128/iai.69.11.6573-6579.2001

Enteropathogenic <i>Escherichia</i> <i>coli</i> Virulence Factor Bundle-Forming Pilus Has a Binding Specificity for Phosphatidylethanolamine

2001· article· en· W2144480372 sur OpenAlexafffund
Cezar M. Khursigara, Maan Abul-Milh, B. Lau, Jorge A. Girón, Clifford A. Lingwood, Debora Barnett Foster

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenMedical Research CouncilCrohn's and Colitis Foundation of CanadaMedical Research Council CanadaCrohn's and Colitis Foundation
Mots-clésPilusBiologyEnteropathogenic Escherichia coliMicrobiologyPlasmidEscherichia coliVirulenceBacterial adhesinVirulence factorPhosphatidylethanolamineMutantLiposomePhosphatidylcholineGeneBiochemistryPhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bundle-forming pilus (BFP) of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), an established virulence factor encoded on the EPEC adherence factor (EAF) plasmid, has been implicated in the formation of bacterial autoaggregates and in the localized adherence of EPEC to cultured epithelial cells. While understanding of the pathogenic mechanism of this organism is rapidly improving, a receptor ligand for BFP has not yet been identified. We now report, using both solid-phase and liposome binding assays, that BFP expression correlates with phosphatidylethanolamine (PE) binding. In a thin-layer chromatogram overlay assay, specific recognition of PE was documented for BFP-expressing strains, including E2348/69, a wild-type EPEC clinical isolate, as well as a laboratory strain, HB101, transformed with a bfp-carrying plasmid. Strains which did not express BFP did not bind PE, including a bfpA disruptional mutant of E2348/69, EAF plasmid-cured E2348/69, and HB101. E2348/69 also aggregated PE-containing liposomes but not phosphatidylcholine- or phosphatidylserine-containing liposomes, while BFP-negative strains did not produce aggregates with any tested liposomes. Purified BFP preparations bound commercial PE standards as well as a PE-containing band within lipid extracts from human epithelial cells and from E2348/69. Our results therefore indicate a specific interaction between BFP and PE and suggest that PE may serve as a BFP receptor for bacterial autoaggregation and may promote localized adherence to host cells, both of which contribute to bacterial pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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