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Enregistrement W2144512169 · doi:10.1677/jme.0.0270043

Regulation of apoA1 gene expression with acidosis: requirement for a transcriptional repressor

2001· article· en· W2144512169 sur OpenAlexaff
MJ Haas, Deanna Reinacher, JP Li, NC Wong, AD Mooradian

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepressorMolecular biologyPsychological repressionBiologyGene expressionRegulation of gene expressionProtein kinase CResponse elementTranscriptional regulationGeneChemistryPromoterKinaseBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serum apolipoprotein A(1) (apoA(1)) concentration is inversely correlated with the risk of premature atherosclerosis. Serum apoA(1) concentrations are regulated, in part, at the transcriptional level. ApoA(1) mRNA is synthesized primarily in the liver and small intestine, under the direction of a number of signaling molecules and tissue-specific regulatory elements. Previously, we demonstrated that extracellular acidosis suppresses apoA(1) mRNA levels at the level of transcription. Here we demonstrate that intracellular acidosis, in the absence of extracellular pH changes, represses apoA(1) promoter activity. Repression occurs through a pH responsive element (pH-RE) located within the apoA(1) gene promoter. Acidosis increases the specific DNA binding activity of a putative repressor protein within the immediate 5'-flanking region of the apoA(1) gene. The cis-element that binds the putative repressor protein contains a negative thyroid hormone response element (nTRE) located 3' and adjacent to the apoA(1) TATA box. Mutation of the nTRE/pH-RE abrogates protein binding and alters the activity of reporter genes controlled by this element. Repression by acidosis did not require de novo mRNA and protein synthesis. Inhibition of tyrosine kinase activity and diacylglycerol-stimulated protein kinase C (PKC) signaling pathways with tyrophostin A47 and phorbol myristate acetate, respectively, did not affect the repression of apoA(1) promoter activity with acidosis. These results suggest that transcriptional repression of the apoA(1) gene by alterations in ambient pH is associated with enhanced DNA binding activity of a repressor protein, through a mechanism which appears to be independent of de novo mRNA and protein synthesis, tyrosine kinase activity, or PKC activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,532

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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