Cell density during differentiation can alter the phenotype of bone marrow-derived macrophages
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Bone marrow-derived macrophages (BMDMs) are widely used primary cells for studying macrophage function. However, despite numerous protocols that are currently available, lack of a notable consensus on generating BMDMs may obscure the reliability in comparing findings from different studies or laboratories. FINDINGS: In this study, we addressed the effect of cell density on the resulting macrophage population. With reference to previously published methods, bone marrow cells from wild type C57BL/6 mice were plated at either 4 × 10(5) cells or 5 × 10(6) cells per 10 cm and cultured in 20% L-cell conditioned media for 7 days, after which they were analyzed for cell surface markers, production of proinflammatory cytokines, and responsiveness to polarizing signals. Reproducibly, cells plated at lower density gave a pure population of CD11b(+)F4/80(+) macrophages (97.28 ± 0.52%) with majority being Ly-6C(-)Ly-6G(-) and c-Fms(+), while those plated at higher density produced less CD11b(+)F4/80(+) cells and a considerably higher proportion of CD11b(+)F4/80(+)CD11c(+) (68.72 ± 2.52%) and Ly-6C(-)Ly-6G(+) (71.10 ± 0.90%) cells. BMDMs derived from higher plating density also secreted less proinflammatory cytokines such as IL-6, IL-12 and TNF-α and were less phagocytic, and had a different pattern of expression for M1- and M2-related genes upon LPS or IL-4 stimulation. CONCLUSIONS: Overall, our findings indicate that altering cell density during BMDM differentiation can give rise to distinct macrophage populations that could vary the outcome of a functional study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».