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Enregistrement W2144610656 · doi:10.1111/j.1740-0929.2007.00449.x

Accounting for heterogeneity of variances to improve the precision of QTL mapping in dairy cattle

2007· article· en· W2144610656 sur OpenAlex
Yuefu Liu, G.B. Jansen, Ching Y. Lin

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAnimal Science Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuantitative trait locusInclusive composite interval mappingHeteroscedasticityFamily-based QTL mappingVariance (accounting)SireResidualStatisticsComputer scienceMathematicsBiologyGene mappingGeneticsAccountingAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The principle of interval mapping for quantitative trait loci (QTL) was originally developed for the analysis of single backcross data but it has been increasingly applied to more complicated experimental designs and data structures. It is important to study whether accounting for the heterogeneity of variance would improve the precision of QTL mapping based on data of multiple populations or families. This study compared homogeneous and heterogeneous maximum likelihood approaches for QTL mapping. The data consisted of 433 sons from six sire families with 69 microsatellite markers distributed over 12 chromosomes. The results of this study indicate that the heterogeneous approach generally produced a smaller residual variance and thus provided a better fit to the data than the homogeneous approach, meaning that the heterogeneous approach offers better precision in estimating both positions and effects of QTL. The results further showed that accounting for the heterogeneity of residual variance led to different statistical inferences from ignoring the heterogeneity of variance in QTL mapping. The heterogeneous approach is useful for QTL mapping based on the joint data of diverse reference populations or heteroscedastic data obtained from crossing animals with different genetic backgrounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,550
Score d'incertitude au seuil0,147

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle