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Enregistrement W2144648281 · doi:10.1158/0008-5472.can-14-2012

Novel Associations between Common Breast Cancer Susceptibility Variants and Risk-Predicting Mammographic Density Measures

2015· article· en· W2144648281 sur OpenAlexafffund
Jennifer Stone, Deborah J. Thompson, Isabel dos‐Santos‐Silva, Christopher G. Scott, Rulla M. Tamimi, Sara Lindström, Peter Kraft, Aditi Hazra, Jingmei Li, Louise Eriksson, Kamila Czene, Per Hall, Matt Jensen, Julie M. Cunningham, Janet E. Olson, Kristen S. Purrington, Fergus J. Couch, Judith Brown, Jean Leyland, Ruth Warren, Robert Luben, Kay‐Tee Khaw, Paula Smith, Nicholas J. Wareham, Sebastian M. Jud, Katharina Heusinger, Matthias W. Beckmann, Julie A. Douglas, Kaanan P. Shah, Heang‐Ping Chan, Mark A. Helvie, Loı̈c Le Marchand, Laurence N. Kolonel, Christy Woolcott, Gertraud Maskarinec, Christopher A. Haiman, Graham G. Giles, Laura Baglietto, Kavitha Krishnan, Melissa C. Southey, Carmel Apicella, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Giske Ursin, Grethe I.G. Alnæs, Vessela N. Kristensen, Anne‐Lise Børresen‐Dale, Inger Torhild Gram, Manjeet K. Bolla, Qin Wang, Kyriaki Michailidou, Joe Dennis, Jacques Simard, Paul D.P. Pharoah, Alison M. Dunning, Douglas F. Easton, Peter A. Fasching, V. Shane Pankratz, John L. Hopper, Celine M. Vachon

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDigital Radiography and Breast Imaging
Établissements canadiensPublic Health OntarioCapital District Health AuthorityAmgen (Canada)Lunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoCentre hospitalier universitaire de QuébecIzaak Walton Killam Health Centre
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research CouncilNational Cancer InstituteCancer Research UKFrancis Crick Institute
Mots-clésMAMMOGRAPHIC DENSITYBreast cancerMedicineOncologyCancerMammographyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammographic density measures adjusted for age and body mass index (BMI) are heritable predictors of breast cancer risk, but few mammographic density-associated genetic variants have been identified. Using data for 10,727 women from two international consortia, we estimated associations between 77 common breast cancer susceptibility variants and absolute dense area, percent dense area and absolute nondense area adjusted for study, age, and BMI using mixed linear modeling. We found strong support for established associations between rs10995190 (in the region of ZNF365), rs2046210 (ESR1), and rs3817198 (LSP1) and adjusted absolute and percent dense areas (all P < 10(-5)). Of 41 recently discovered breast cancer susceptibility variants, associations were found between rs1432679 (EBF1), rs17817449 (MIR1972-2: FTO), rs12710696 (2p24.1), and rs3757318 (ESR1) and adjusted absolute and percent dense areas, respectively. There were associations between rs6001930 (MKL1) and both adjusted absolute dense and nondense areas, and between rs17356907 (NTN4) and adjusted absolute nondense area. Trends in all but two associations were consistent with those for breast cancer risk. Results suggested that 18% of breast cancer susceptibility variants were associated with at least one mammographic density measure. Genetic variants at multiple loci were associated with both breast cancer risk and the mammographic density measures. Further understanding of the underlying mechanisms at these loci could help identify etiologic pathways implicated in how mammographic density predicts breast cancer risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,975

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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