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Enregistrement W2144720355 · doi:10.1158/0008-5472.can-03-3380

A Genetically Defined Model for Human Ovarian Cancer

2004· article· en· W2144720355 sur OpenAlexaff
Jinsong Liu, Gong Yang, Jennifer A. Thompson-Lanza, Armand B. Glassman, Kimberly Hayes, Andrea P. Patterson, Rebecca T. Marquez, Nelly Auersperg, Yinhua Yu, William C. Hahn, Gordon B. Mills, Robert C. Bast

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésOvarian cancerTelomerase reverse transcriptaseCancer researchBiologyHRASCancerOvarian tumorKRASPancreatic cancerOvarian carcinomaCancer cellTelomeraseColorectal cancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disruptions of the p53, retinoblastoma (Rb), and RAS signaling pathways and activation of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) are common in human ovarian cancer; however, their precise role in ovarian cancer development is not clear. We thus introduced the catalytic subunit of hTERT, the SV40 early genomic region, and the oncogenic alleles of human HRAS or KRAS into human ovarian surface epithelial cells and examined the phenotype and gene expression profile of those cells. Disruption of p53 and Rb pathway by SV40 early genomic region and hTERT immortalized but did not transform the cells. Introduction of HRAS(V12) or KRAS(V12) into the immortalized cells, however, allowed them to form s.c. tumors after injection into immunocompromised mice. Peritoneal injection of the transformed cells produced undifferentiated carcinoma or malignant mixed Mullerian tumor and developed ascites; the tumor cells are focally positive for CA125 and mesothelin. Gene expression profile analysis of transformed cells revealed elevated expression of several cytokines, including interleukin (IL)-1beta, IL-6, and IL-8, that are up-regulated by the nuclear factor-kappaB pathway, which is known to contribute to the tumor growth of naturally ovarian cancer cells. Incubation with antibodies to IL-1beta or IL-8 led to apoptosis in the ras-transformed cells and ovarian cancer cells but not in immortalized cells that had not been transformed. Thus, the transformed human ovarian surface epithelial cells recapitulated many features of natural ovarian cancer including a subtype of ovarian cancer histology, formation of ascites, CA125 expression, and nuclear factor-kappaB-mediated cytokine activation. These cells provide a novel model system to study human ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,193
Tête enseignante GPT0,469
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations274
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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