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Enregistrement W2144810687 · doi:10.1186/1756-6606-3-6

Scanning mutagenesis of the I-II loop of the Cav2.2 calcium channel identifies residues Arginine 376 and Valine 416 as molecular determinants of voltage dependent G protein inhibition

2010· article· en· W2144810687 sur OpenAlexafffund
Hugo W. Tedford, Alexandra E. Kisilevsky, Lucienne B Vieira, Diego Varela, Lina Chen, Gerald W. Zamponi

Notice bibliographique

RevueMolecular Brain · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchFondation pour la Recherche MédicaleNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésProtein subunitAlanine scanningCalcium channelVoltage-dependent calcium channelAlanineMutagenesisChemistryHeterotrimeric G proteinN-type calcium channelBiochemistryMutantWild typeL-type calcium channelBiophysicsAmino acidBiologyG proteinCalciumT-type calcium channelSignal transductionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Direct interaction with the beta subunit of the heterotrimeric G protein complex causes voltage-dependent inhibition of N-type calcium channels. To further characterize the molecular determinants of this interaction, we performed scanning mutagenesis of residues 372-387 and 410-428 of the N-type channel alpha1 subunit, in which individual residues were replaced by either alanine or cysteine. We coexpressed wild type Gbeta1gamma2 subunits with either wild type or point mutant N-type calcium channels, and voltage-dependent, G protein-mediated inhibition of the channels (VDI) was assessed using patch clamp recordings. The resulting data indicate that Arg376 and Val416 of the alpha1 subunit, residues which are surface-exposed in the presence of the calcium channel beta subunit, contribute significantly to the functional inhibition by Gbeta1. To further characterize the roles of Arg376 and Val416 in this interaction, we performed secondary mutagenesis of these residues, coexpressing the resulting mutants with wild type Gbeta1gamma2 subunits and with several isoforms of the auxiliary beta subunit of the N-type channel, again assessing VDI using patch clamp recordings. The results confirm the importance of Arg376 for G protein-mediated inhibition and show that a single amino acid substitution to phenylalanine drastically alters the abilities of auxiliary calcium channel subunits to regulate G protein inhibition of the channel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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