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Enregistrement W2144818766 · doi:10.1186/1710-1492-10-2

T cell unresponsiveness in a pediatric cystic fibrosis patient: a case report

2014· article· en· W2144818766 sur OpenAlexafffundvenue
Rahul Kushwah, Stéphane Gagnon, Neil Sweezey

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCystic fibrosisImmunologyT cellImmune systemMedicineInflammationTransplantationLungEx vivoCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorBiologyInternal medicineIn vivo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A girl was diagnosed with cystic fibrosis (CF) at birth, with repeatedly positive sweat tests and homozygous F508del mutations of her CF transmembrane conductance regulator (CFTR) gene. From an early age, her lung disease was more severe than her birth cohort peers despite aggressive treatment. At the age of 16 she was listed for lung transplantation, but prior to transplant was not on systemic corticosteroids or other immunosuppressive agents. In response to ex vivo stimulation, her pre-transplant peripheral blood T cells unexpectedly failed to produce detectable levels of IFN-γ, unlike cells from healthy controls or from another girl with CF and lung disease of comparable severity. Furthermore, naïve T cells freshly isolated from her peripheral blood showed a complete block of T cell differentiation into Th1, Th17 and Treg lineages, even in the presence of cytokines known to promote differentiation into the respective lineages. Her serology has been remarkably devoid of evidence of exposure to viruses that have been associated with T cell exhaustion. However, her freshly isolated naïve T cells showed sustained expression of markers of T cell exhaustion, which were further induced upon ex vivo stimulation, pointing to T cell exhaustion as the cause of the failure of naïve T cells to undergo differentiation in response to cytokine stimulation. Although excessive inflammation in CF lung can be both ineffective at clearing certain pathogens as well as destructive to the lung tissue itself, adequate inflammation is a component of an effective overall immune response to microbial pathogens. Our present findings suggest that intrinsic impairment of T cell differentiation may have contributed to the greater severity and more rapid progression of her CF lung disease than of the lung disease of most of her peers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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