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Enregistrement W2144951760 · doi:10.3389/fmicb.2013.00112

Links between metabolic plasticity and functional redundancy in freshwater bacterioplankton communities

2013· article· en· W2144951760 sur OpenAlexaff
Jérôme Comte, Lisa Fauteux, Paul A. del Giorgio

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversité LavalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRedundancy (engineering)Phenotypic plasticityBiologyBacterioplanktonPlasticityEcologyEctothermAbiotic componentBiological systemNutrientComputer sciencePhytoplankton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolic plasticity and functional redundancy are fundamental properties of microbial communities, which shape their response to environmental forcing, and also mediate the relationship between community composition and function. Yet, the actual quantification of these emergent community properties has been elusive, and we thus do not know how they vary across bacterial communities, and their relationship to environmental gradients and to each other. Here we present an experimental framework that allows us to simultaneously quantify metabolic plasticity and functional redundancy in freshwater bacterioplankton communities, and to explore connections that may exists between them. We define metabolic plasticity as the rate of change in single-cell properties (cell wall integrity, cell size, single-cell activity) relative to changes in community composition. Likewise, we define functional redundancy as the rate of change in carbon substrate uptake capacities relative to changes in community composition. We assessed these two key community attributes in transplant experiments where bacterioplankton from various aquatic habitats within the same watershed were transplanted from their original water to waters from other systems that differ in their main resources. Our results show that metabolic plasticity is an intrinsic property of bacterial communities, whereas the expression of functional redundancy appears to be more dependent on environmental factors. Furthermore, there was an overall strong positive relationship between the level of functional redundancy and of metabolic plasticity, suggesting no trade-offs between these community attributes but rather a possible co-selection. The apparent continuum in the expression of both functional redundancy and plasticity among bacterial communities and the link between them, in turn suggest that the link between community diversity and function may also vary along a continuum, from being very tight, to being weak, or absent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,455
Score d'incertitude au seuil0,648

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations129
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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