<i>Tomato Ringspot Virus</i> Proteins Containing the Nucleoside Triphosphate Binding Domain Are Transmembrane Proteins That Associate with the Endoplasmic Reticulum and Cofractionate with Replication Complexes
Notice bibliographique
Résumé
Replication of all known positive-strand RNA viruses occurs in replication complexes associated with intracellular membranes. The putative nucleoside triphosphate binding (NTB) protein of Tomato ringspot virus (ToRSV) contains a stretch of hydrophobic residues at its C terminus, suggesting that it may act as a membrane anchor for the replication complex. Anti-NTB antibodies detected two predominant proteins in membrane-enriched fractions (the 66-kDa NTB and 69-kDa NTB-VPg proteins) along with other, larger proteins. The proteins containing the NTB domain cofractionated with markers of the endoplasmic reticulum (ER) and with ToRSV-specific RNA-dependent RNA polymerase activity in sucrose gradients. ToRSV infection induced severe changes in the morphology of the ER in plants expressing an ER-targeted green fluorescent protein (ER-GFP), and proteins containing the NTB domain colocalized with ER-GFP in indirect immunofluorescence assays. The proteins containing the NTB domain have properties of integral membrane proteins. Proteinase K protection assays using purified membranes from infected plants revealed that although the central portion of the NTB domain is exposed to the cytoplasmic face of the membranes, an 8-kDa fragment, recognized by anti-VPg antibodies, is protected by the membranes. This fragment probably consists of the 3-kDa VPg and the 5-kDa stretch of hydrophobic residues at the C terminus of the NTB protein, suggesting a luminal location for the VPg in at least a portion of the molecules. These results provide evidence that proteins containing the NTB domain are transmembrane proteins associated with ER-derived membranes and support the hypothesis that one or several of the proteins containing the NTB domain anchor the replication complex to the ER.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».