Analysis of HSC activity and compensatory Hox gene expression profile in Hoxb cluster mutant fetal liver cells
Notice bibliographique
Résumé
Overexpression of Hoxb4 in bone marrow cells promotes expansion of hematopoietic stem cell (HSC) populations in vivo and in vitro, indicating that this homeoprotein can activate the genetic program that determines self-renewal. However, this function cannot be solely attributed to Hoxb4 because Hoxb4(-/-) mice are viable and have an apparently normal HSC number. Quantitative polymerase chain reaction analysis showed that Hoxb4(-/-) c-Kit+ fetal liver cells expressed moderately higher levels of several Hoxb cluster genes than control cells, raising the possibility that normal HSC activity in Hoxb4(-/-) mice is due to a compensatory up-regulation of other Hoxb genes. In this study, we investigated the competitive repopulation potential of HSCs lacking Hoxb4 alone, or in conjunction with 8 other Hoxb genes. Our results show that Hoxb4(-/-) and Hoxb1-b9 (-/-) fetal liver cells retain full competitive repopulation potential and the ability to regenerate all myeloid and lymphoid lineages. Quantitative Hox gene expression profiling in purified c-Kit+ Hoxb1-b9(-/-) fetal liver cells revealed an interaction between the Hoxa, b, and c clusters with variation in expression levels of Hoxa4,-a11, and -c4.Together, these studies show a complex network of genetic interactions between several Hox genes in primitive hematopoietic cells and demonstrate that HSCs lacking up to 30% of the active Hox genes remain fully competent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».