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Enregistrement W2145146019 · doi:10.1002/jcb.10121

Nucleolin is a calcium‐binding protein

2002· article· en· W2145146019 sur OpenAlexaff
James S.C. Gilchrist, Bernard Abrenica, Patrick J. DiMario, Michael P. Czubryt, Grant N. Pierce

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleolinAutolysis (biology)Molecular biologyPeptidePolyacrylamide gel electrophoresisGel electrophoresisBiochemistryChemistrySodium dodecyl sulfateRuthenium redImmunoprecipitationBiologyCalciumCytoplasmEnzymeNucleolus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have purified a prominent 110-kDa protein (p110) from 1.6 M NaCl extracts of rat liver nuclei that appears to bind Ca2+. p110 was originally identified by prominent blue staining with 'Stains-All' in sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gels and was observed to specifically bind ruthenium red and 45Ca2+ in nitrocellulose blot overlays. In spin-dialysis studies, purified p110 saturably bound approximately 75 nmol Ca2+/mg protein at a concentration of 1 mM total Ca2+ with half-maximal binding observed at 105 microM Ca2+. With purification, p110 became increasingly susceptible to proteolytic (likely autolytic) fragmentation, although most intermediary peptides between 40 and 90 kDa retained "Stains-All", ruthenium red, and 45Ca2+ binding. N-terminal sequencing of intact p110 and a 70-kDa autolytic peptide fragment revealed a strong homology to nucleolin. Two-dimensional sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE)/IEF revealed autolysis produced increasingly acidic peptide fragments ranging in apparent pI's from 5.5 for intact p110 to 3.5 for a 40 kDa peptide fragment. Intact p110 and several peptide fragments were immunostained with a highly specific anti-nucleolin antibody, R2D2, thus confirming the identity of this protein with nucleolin. These annexin-like Ca2+-binding characteristics of nucleolin are likely contributed by its highly acidic argyrophilic N-terminus with autolysis apparently resulting in largely selective removal of its basic C-terminal domain. Although the Ca2+-dependent functions of nucleolin are unknown, we discuss the possibility that like the structurally analogous HMG-1, its Ca2+-dependent actions may regulate chromatin structure, possibly during apoptosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,776

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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