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Enregistrement W2145233704 · doi:10.1161/circgenetics.112.963363

Toronto Hypertrophic Cardiomyopathy Genotype Score for Prediction of a Positive Genotype in Hypertrophic Cardiomyopathy

2012· article· en· W2145233704 sur OpenAlexaffabout
Christiane Gruner, Joan Ivanov, Melanie Care, Lynne Williams, Gil Moravsky, Hua Yang, Balint Laczay, Katherine A. Siminovitch, Anna Woo, Harry Rakowski

Notice bibliographique

RevueCirculation Cardiovascular Genetics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health NetworkMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypertrophic cardiomyopathyMedicineInternal medicineGenotypeCardiomyopathyCardiologyReceiver operating characteristicLogistic regressionFamily historyGeneticsHeart failureBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genotyping in hypertrophic cardiomyopathy has gained increasing attention in the past decade. Its major role is for family screening and rarely influences decision-making processes in any individual patient. It is associated with substantial costs, and cost-effectiveness can only be achieved in the presence of high-detection rates for disease-causing sarcomere protein gene mutations. Therefore, our aim was to develop a score based on clinical and echocardiographic variables that allows prediction of the probability of a positive genotype. METHODS AND RESULTS: Clinical and echocardiographic variables were collected in 471 consecutive patients undergoing genetic testing at a tertiary referral center between July 2005 and November 2010. Logistic regression for a positive genotype was used to construct integer risk weights for each independent predictor variable. These were summed for each patient to create the Toronto hypertrophic cardiomyopathy genotype score. A positive genotype was found in 163 of 471 patients (35%). Independent predictors with associated-risk weights in parentheses were as follows: age at diagnosis 20 to 29 (-1), 30 to 39 (-2), 40 to 49 (-3), 50 to 59 (-4), 60 to 69 (-5), 70 to 79 (-6), ≥80 (-7); female sex (4); arterial hypertension (-4); positive family history for hypertrophic cardiomyopathy (6); morphology category (5); ratio of maximal wall thickness:posterior wall thickness <1.46 (0), 1.47 to 1.70 (1), 1.71 to 1.92 (2), 1.93 to 2.26 (3), ≥2.27 (4). The model had a receiver operator curve of 0.80 and Hosmer-Lemeshow goodness-of-fit P=0.22. CONCLUSIONS: The Toronto genotype score is an accurate tool to predict a positive genotype in a hypertrophic cardiomyopathy cohort at a tertiary referral center.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,988
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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