Identification of transcriptional and phosphatase regulators as interaction partners of human ADA3, a component of histone acetyltransferase complexes
Notice bibliographique
Résumé
ADA (alteration/deficiency in activation) 3 is a conserved component of several transcriptional adaptor and HAT (histone acetyltransferase) complexes that regulate RNA polymerase II-mediated gene expression. Within the HAT complexes ADA3 is associated with ADA2 and the HAT GCN5 (general control non-repressed 5). ADA3 plays roles in diverse cellular processes and also in malignancies by modulating GCN5 catalytic activity and/or by interactions with other regulators. To gain a better understanding of ADA3 function, we used a yeast two-hybrid approach to screen a human fetal cDNA library for proteins that interacted with hADA3 (human ADA3). We identified three novel hADA3-interacting partners, a transcriptional regulator, AATF (apoptosis-antagonizing transcription factor), and regulatory subunits of the PP1 (protein phosphatase 1) and PP2A (protein phosphatase 2A) [PPP1R7 (PP1 regulatory subunit 7) and PPP2R5D (PP2A 56 kDa regulatory subunit δ isoform) respectively]. Analysis of truncated versions of hADA3 indicated that the C-terminal ADA2-interacting domain was not required for these interactions. Fluorescent microscopy analysis and co-immunoprecipitation provided support for the co-localization and interaction of hADA3 with these proteins in human cells. Expression of the interacting proteins altered expression of an hADA3-regulated reporter gene, suggesting functional consequences for the interactions. The detected interactions of hADA3 might extend the spectrum of mechanisms by which ADA3 can contribute to the regulation of gene expression and shed light on processes mediated by these newly identified ADA3 partners.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».