MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2145310134 · doi:10.14814/phy2.12269

An assessment of human gastric fluid composition as a function of PPI usage

2015· article· en· W2145310134 sur OpenAlexaff
Emily Foltz, S. Azad, Mary Lou Everett, Zoie E. Holzknecht, Nathan L. Sanders, J. Will Thompson, Laura G. Dubois, William Parker, Shaf Keshavjee, Scott M. Palmer, R. Duane Davis, Shu S. Lin

Notice bibliographique

RevuePhysiological Reports · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastroesophageal reflux and treatments
Établissements canadiensToronto General Hospital
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésPepsinTrypsinGastric fluidStomachGastroenterologyMedicineInternal medicineChemistryPopulationChromatographyEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The standard of care for chronic gastro-esophageal reflux disease (GERD), which affects up to 40% of the population, is the use of drugs such as proton pump inhibitors (PPIs) that block the production of stomach acid. Despite widespread use, the effects of PPIs on gastric fluid remain poorly characterized. In this study, gastric fluid was collected from patients undergoing cardiac surgery who were not (n = 40) or were (n = 25) actively taking PPIs. Various enzymatic and immunoassays as well as mass spectrometry were utilized to analyze the concentrations of bile, gastricsin, trypsin, and pepsin in the gastric fluid. Proteomic analyses by mass spectrometry suggested that degradation of trypsin at low pH might account, at least in part, for the observation that patients taking PPIs have a greater likelihood of having high concentrations of trypsin in their gastric fluid. In general, the concentrations of all analytes evaluated varied over several orders of magnitude, covering a minimum of a 2000-fold range (gastricsin) and a maximum of a 1 × 10(6) -fold range (trypsin). Furthermore, the concentrations of various analytes were poorly correlated with one another in the samples. For example, trypsin and bile concentrations showed a significant (P < 0.0001) but not strong correlation (r = 0.54). Finally, direct assessment of bacterial concentrations by flow cytometry revealed that PPIs did not cause a profound increase in microbial load in the gastric fluid. These results further delineate the profound effects that PPI usage has on the physiology of the stomach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhysiological ReportsMême sujetGastroesophageal reflux and treatmentsTravaux en français237 207