Nearly Identical Bacteriophage Structural Gene Sequences Are Widely Distributed in both Marine and Freshwater Environments
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Primers were designed to amplify a 592-bp region within a conserved structural gene (g20) found in some cyanophages. The goal was to use this gene as a proxy to infer genetic richness in natural cyanophage communities and to determine if sequences were more similar in similar environments. Gene products were amplified from samples from the Gulf of Mexico, the Arctic, Southern, and Northeast and Southeast Pacific Oceans, an Arctic cyanobacterial mat, a catfish production pond, lakes in Canada and Germany, and a depth of ca. 3,246 m in the Chuckchi Sea. Amplicons were separated by denaturing gradient gel electrophoresis, and selected bands were sequenced. Phylogenetic analysis revealed four previously unknown groups of g20 clusters, two of which were entirely found in freshwater. Also, sequences with >99% identities were recovered from environments that differed greatly in temperature and salinity. For example, nearly identical sequences were recovered from the Gulf of Mexico, the Southern Pacific Ocean, an Arctic freshwater cyanobacterial mat, and Lake Constance, Germany. These results imply that closely related hosts and the viruses infecting them are distributed widely across environments or that horizontal gene exchange occurs among phage communities from very different environments. Moreover, the amplification of g20 products from deep in the cyanobacterium-sparse Chuckchi Sea suggests that this primer set targets bacteriophages other than those infecting cyanobacteria.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle