Surveillance for plasmid-mediated quinolone resistance determinants in Enterobacteriaceae within the Calgary Health Region, Canada: the emergence of aac(6')-Ib-cr
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: A study was designed to determine the prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) determinants among clinical isolates of Enterobacteriaceae from the Calgary Health Region (CHR). METHODS: During January and February 2004 and January and February 2007, 564 non-repeat isolates of Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus mirabilis and Morganella morganii resistant to ciprofloxacin and/or tobramycin were screened for PMQR determinants using a multiplex PCR for qnrA, qnrS and qnrB and aac(6')-Ib genes; aac(6')-Ib-cr was further identified by digestion with BstF5I. RESULTS: In 2004, 6/139 (4%) of the resistant E. coli were positive for aac(6')-Ib-cr. In 2007, 53/398 (13%) were positive for aac(6')-Ib-cr, 3/398 (0.8%) were positive for qnrS, and one isolate was positive for both. All the isolates were present in urines and the majority [40/63 (63%)] were submitted from community collection sites; 8 (13%) isolates co-produced AmpC beta-lactamases and 34 (54%) co-produced CTX-M-15. aac(6')-Ib-cr was present in one Klebsiella pneumoniae and one P. mirabilis, whereas one isolate of K. pneumoniae was positive for both aac(6')-Ib-cr and qnrB. CONCLUSIONS: Our results showed that isolates with aac(6')-Ib-cr, often associated with CTX-M-15, are emerging among fluoroquinolone-resistant E. coli in the CHR. Our study suggests that surveillance for PMQR determinants should be undertaken on a regular basis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».