An Expanded Inventory of Conserved Meiotic Genes Provides Evidence for Sex in Trichomonas vaginalis
Notice bibliographique
Résumé
Meiosis is a defining feature of eukaryotes but its phylogenetic distribution has not been broadly determined, especially among eukaryotic microorganisms (i.e. protists)-which represent the majority of eukaryotic 'supergroups'. We surveyed genomes of animals, fungi, plants and protists for meiotic genes, focusing on the evolutionarily divergent parasitic protist Trichomonas vaginalis. We identified homologs of 29 components of the meiotic recombination machinery, as well as the synaptonemal and meiotic sister chromatid cohesion complexes. T. vaginalis has orthologs of 27 of 29 meiotic genes, including eight of nine genes that encode meiosis-specific proteins in model organisms. Although meiosis has not been observed in T. vaginalis, our findings suggest it is either currently sexual or a recent asexual, consistent with observed, albeit unusual, sexual cycles in their distant parabasalid relatives, the hypermastigotes. T. vaginalis may use meiotic gene homologs to mediate homologous recombination and genetic exchange. Overall, this expanded inventory of meiotic genes forms a useful "meiosis detection toolkit". Our analyses indicate that these meiotic genes arose, or were already present, early in eukaryotic evolution; thus, the eukaryotic cenancestor contained most or all components of this set and was likely capable of performing meiotic recombination using near-universal meiotic machinery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».