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Enregistrement W2145353373 · doi:10.1158/1535-7163.mct-05-0033

Identification of genes and molecular pathways involved in the progression of premalignant oral epithelia

2005· article· en· W2145353373 sur OpenAlexaff
Abhijit G. Banerjee, Indraneel Bhattacharyya, Jamboor K. Vishwanatha

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésIdentification (biology)GeneBiologyCancerGeneticsComputational biologyCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An early interventional effort in oral premalignancy requires novel molecular targets and diagnostic biomarkers to delay or reverse incidences of malignant progression. Microarray-based transcriptional profiling in disease states provides global insight into the causal biomolecular processes and novel pathways involved. In this study, we investigated transcript profiles in precancerous oral lesions to identify nearly 1,700 genes as significantly overexpressed or underexpressed and a primarily affected metabolic pathway that may be responsible for irreversible transition to progressive stages of oral cancer. For the first time, we show a convergence of several genes and pathways known for their oncogenic capabilities, in progression of premalignant oral epithelial tissues. This study consequently provides a molecular basis for persistent proinflammatory conditions in oral premalignant tissues. We found that lipocalin-type prostaglandin D(2) synthase (PTGDS), a key enzyme in the arachidonic acid metabolism pathway, as repressed in premalignant stages. We show the protective role of these enzyme-derived metabolites in inhibiting cell proliferation using an in vitro oral cancer progression model. We have also confirmed the overexpression of two invasion-related biomarkers, psoriasin (PSOR1) and versican (CSPG2), in oral premalignant and malignant archival tissues. Our results clearly indicate that pharmacologic intervention with anti-inflammatory prostaglandin D(2)-like analogues may help prevent or delay oral epithelial carcinogenesis because of metabolic restoration of a negative feedback regulatory loop through its several cognate receptors or target molecules. Further studies directed toward a multitude of possible protective mechanisms of this lipocalin-type enzyme or its products in oral cancer progression are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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