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Enregistrement W2145366229 · doi:10.1128/jcm.01627-13

Impact of Blood Volume, Tube Shaking, and Incubation Time on Reproducibility of QuantiFERON-TB Gold In-Tube Assay

2013· article· en· W2145366229 sur OpenAlexaff
Rajiv L. Gaur, Madhukar Pai, Niaz Banaei

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineReproducibilityInternal medicineIncubationTuberculosisIncubation periodGastroenterologyWhole bloodLatent tuberculosisMycobacterium tuberculosisImmunologyPathologyChemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gamma interferon (IFN-γ) release assays (IGRAs) are functional assays used serially to measure the efficacy of novel tuberculosis (TB) vaccines and to screen health care workers for latent tuberculosis infection (LTBI). However, studies have shown nonreproducible IGRA results. In this study, we investigated the effects of blood volume (0.8, 1.0, and 1.2 ml), tube shaking (gentle versus vigorous), and incubation duration (16, 20, and 24 h) on the reproducibility of QuantiFERON-TB Gold In-Tube (QFT-GIT) results for 50 subjects (33 uninfected and 17 infected). The median IFN-γ TB response (TB antigen [Ag] minus nil value) was significantly higher with 0.8 ml blood (1.04 IU/ml) than with 1.0 ml (0.85 IU/ml; P = 0.002) or 1.2 ml (0.49 IU/ml; P < 0.001) for subjects with LTBI. Compared with 0.8 ml (11.8%), there were larger proportions of false-negative results with 1.0 ml (29.4%; P = 0.2) and 1.2 ml (41.2%; P = 0.05) of blood for infected subjects. Blood volume did not significantly change the proportions of positive results in uninfected controls. Compared with gentle shaking, vigorous shaking increased the median IFN-γ response in nil (0.04 versus 0.06 IU/ml; P < 0.001) and TB Ag (0.12 versus 0.24 IU/ml; P = 0.004) tubes and increased TB responses (TB Agvigorous minus nilgentle) (0.02 versus 0.08 IU/ml; P = 0.004). The duration of incubation did not have a significant impact on the proportion of positive results in uninfected or infected subjects. This study identified blood volume and tube shaking as novel preanalytical sources of variability which require further standardization in order to improve the quality and reproducibility of QFT-GIT results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,043
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,210
Score d'incertitude au seuil0,965

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,043
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,428
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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