MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2145400049 · doi:10.1242/jeb.052860

The influence of trout cardiac troponin I and PKA phosphorylation on the Ca2+ affinity of the cardiac troponin complex

2011· article· en· W2145400049 sur OpenAlexafffund
Kelly P. Kirkpatrick, A. Robertson, Jordan M. Klaiman, Todd E. Gillis

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTroutTroponinInternal medicineTroponin IPhosphorylationCardiologyRainbow troutChemistryBiochemistryMedicineBiologyFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The trout heart is 10-fold more sensitive to Ca(2+) than the mammalian heart. This difference is due, in part, to cardiac troponin C (cTnC) from trout having a greater Ca(2+) affinity than human cTnC. To determine what other proteins are involved, we cloned cardiac troponin I (cTnI) from the trout heart and determined how it alters the Ca(2+) affinity of a cTn complex containing all mammalian components (mammalian cTn). Ca(2+) activation of the complex was characterized using a human cTnC mutant that contains anilinonapthalenesulfote iodoacetamide attached to Cys53. When the cTn complex containing labeled human cTnC was titrated with Ca(2+), its fluorescence changed, reaching an asymptote upon saturation. Our results reveal that trout cTnI lacks the N-terminal extension found in cTnI from all other vertebrate groups. This protein domain contains two targets (Ser23 and Ser24) for protein kinase A (PKA) and protein kinase C. When these are phosphorylated, the rate of cardiomyocyte relaxation increases. When rat cTnI in the mammalian cTn complex was replaced with trout cTnI, the Ca(2+) affinity was increased ∼1.8-fold. This suggests that trout cTnI contributes to the high Ca(2+) sensitivity of the trout heart. Treatment of the two cTn complexes with PKA decreased the Ca(2+) affinity of both complexes. However, the change for the complex containing rat cTnI was 2.2-fold that of the complex containing trout cTnI. This suggests that the phosphorylation of trout cTnI does not play as significant a role in regulating cTn function in trout.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Experimental BiologyMême sujetCardiomyopathy and Myosin StudiesTravaux en français237 207