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Enregistrement W2145460108 · doi:10.1002/pmic.200800292

Proteomic analysis of alterations in the secretome of <b><i>Arabidopsis thaliana</i></b> suspension cells subjected to nutritional phosphate deficiency

2008· article· en· W2145460108 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésArabidopsis thalianaProteomeBiologyRibonucleaseBiochemistryPiProteomicsProteolysisNucleic acidArabidopsisEnzymeExtracellularMolecular biologyGeneRNAMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A proteomic approach was applied to compare the secretome (culture filtrate proteome) of phosphate-sufficient (+Pi) and Pi-deficient (-Pi) Arabidopsis thaliana suspension cell cultures. Secretomes harvested from the +Pi and -Pi cells yielded dissimilar 2-DE maps. PMF via MALDI-TOF MS resulted in the identification of 50 protein spots representing 37 discrete proteins having unique gene identities. A total of 24 Pi-starvation responsive proteins were identified, with 18 of these being up-regulated and six down-regulated. Secreted proteins up-regulated by the -Pi cells included a ribonuclease involved in Pi scavenging from extracellular nucleic acids, as well as enzymes of cell wall modification, proteolysis, pathogen responses, and ROS metabolism. Enzyme activity assays and immunoblotting demonstrated that a pair of purple acid phosphatase isoforms having subunit M(r)s of 65 and 55 kDa was also secreted by the -Pi cells. Semiquantitative RT-PCR was used to assess the relationship between mRNA levels and relative amounts of selected secretome proteins. The results indicate that transcriptional control is but one of many factors contributing to Arabidopsis Pi starvation responses, and highlight the importance of parallel biochemical/proteomic studies of -Pi plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,374
Score d'incertitude au seuil0,189

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle