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Meta-analysis of Dense Genecentric Association Studies Reveals Common and Uncommon Variants Associated with Height
Matthew B. Lanktree, Yiran Guo, Muhammed Murtaza, Joseph Glessner, Swneke D. Bailey, N. Charlotte Onland‐Moret, Guillaume Lettre, Halit Ongen, Ramakrishnan Rajagopalan, Toby Johnson, Haiqing Shen, Christopher P. Nelson, Norman Klopp, Jens Baumert, Sandosh Padmanabhan, Nathan Pankratz, James S. Pankow, Sonia Shah, Kira C. Taylor, John Barnard, Bas Peters, Cliona M. Maloney, Maximilian T. Lobmeyer, Alice Stanton, Mohammad Hadi Zafarmand, Simon P.R. Romaine, Amar Mehta, Erik P.A. van Iperen, Yan Gong, Erin N. Smith, Cecilia E. Kim, Leslie A. Lange, Folkert W. Asselbergs, Larry D. Atwood, Kristian Bailey, Deepak L. Bhatt, Florianne Bauer, Elijah R. Behr, Tushar Bhangale, Jolanda M.A. Boer, Bernhard O. Boehm, Jonathan P. Bradfield, Peter S. Braund, Paul R. Burton, Cara L. Carty, Hareesh Chandrupatla, Wei Chen, John Connell, Chrysoula Dalgeorgou, Anthonius de Boer, Fotios Drenos, Clara C. Elbers, James C. Fang, Caroline S. Fox, Edward C. Frackelton, Barry D. Fuchs, Clement E. Furlong, Quince Gibson, Christian Gieger, Anuj Goel, D. E. Grobbee, Claire E. Hastie, Philip Howard, Guan-Hua Huang, W. Craig Johnson, Qing Li, Marcus E. Kleber, Barbara E.K. Klein, Ronald Klein, Charles Kooperberg, Bonnie Ky, Andrea Z. LaCroix, Paul N. Lanken, Mark Lathrop, Mingyao Li, Vanessa Marshall, Olle Melander, Frank Mentch, Nuala J. Meyer, Keri L. Monda, Alexandre Montpetit, Gurunathan Murugesan, Karen Nakayama, Dave Nondahl, Abiodun Onipinla, Suzanne Rafelt, Stephen Newhouse, F. George Otieno, Mary Putt, Santiago Rodrı́guez, Radwan Safa, Douglas B. Sawyer, Pamela J. Schreiner, Claire L. Simpson, Suthesh Sivapalaratnam, Sathanur R. Srinivasan, Christine Suver, Gary D. Swergold, Nancy K. Sweitzer, Kelly Thomas, Barbara Thorand, Nicholas J. Timpson, Sam E. Tischfield, Martin D. Tobin, Maciej Tomaszweski, W. M. Monique Verschuren, Chris Wallace, Bernhard R. Winkelmann, Haitao Zhang, Dongling Zheng, Li Zhang, Joseph M. Zmuda, Robert Clarke, Anthony J. Balmforth, John Danesh, Ian N.M. Day, Nicholas J. Schork, Paul I. W. de Bakker, Christian Delles, David Duggan, Aroon D. Hingorani, Joel N. Hirschhorn, Marten H. Hofker, Steve E. Humphries, Mika Kivimäki, Debbie A. Lawlor, Kandice Kottke‐Marchant, Jessica L. Mega, Braxton D. Mitchell, David A. Morrow, Jutta Palmen, Susan Redline, Denis C. Shields, Alan R. Shuldiner, Patrick Sleiman, George Davey Smith, Martin Farrall, Yalda Jamshidi, David C. Christiani, Juan P. Casas, Alistair S. Hall, Pieter A. Doevendans, Jason D. Christie, Gerald S. Berenson, Sarah S. Murray, Thomas Illig, Gerald W. Dorn, Thomas P. Cappola, Eric Boerwinkle, Peter Sever, Daniel J. Rader, Muredach P. Reilly, Mark J. Caulfield, Philippa J. Talmud, Eric J. Topol, James C. Engert, Kai Wang, Anna F. Dominiczak, Anders Hamsten, Sean Curtis, Roy L. Silverstein, Marc S. Sabatine, Mieke D. Trip, Danish Saleheen, John F. Peden, Karen J. Cruickshanks, Winfried März, Jeffrey R. O’Connell, Olaf H. Klungel, Cisca Wijmenga, Anke H. Maitland‐van der Zee, Eric E. Schadt, Julie A. Johnson, Gail P. Jarvik, George Papanicolaou, Struan F.A. Grant, Patricia B. Munroe, Kari E. North, Nilesh J. Samani, Wolfgang Köenig, Tom R. Gaunt, Sonia S. Anand, Yvonne T. van der Schouw, Nicole Soranzo, Garret A. FitzGerald, Alex P. Reiner, Robert A. Hegele, Håkon Håkonarson, Brendan J. Keating
Notice bibliographique
RevueThe American Journal of Human Genetics · 2010
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcMaster UniversityHamilton Health SciencesMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversité de MontréalMontreal Heart InstituteHamilton General HospitalMcGill UniversityWestern University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingBritish Heart FoundationCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of General Medical SciencesOntario Genomics Institute
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGeneticsBiologyGenotypingGenome-wide association studySNPLocus (genetics)Genetic associationMinor allele frequencyQuantitative trait locusAlleleAncestry-informative markerSNP genotypingAllelic heterogeneitySNP arrayGenotypeGene
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,134
Score d'incertitude au seuil0,939
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations132
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentnon