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Enregistrement W2145480429 · doi:10.1152/ajpcell.00062.2008

Regulation of cell surface expression of functional pacemaker channels by a motif in the B-helix of the cyclic nucleotide-binding domain

2008· article· en· W2145480429 sur OpenAlexafffund
Hamed Nazzari, Damiano Angoli, Sarah S. Chow, Gina M. Whitaker, Leisha Leclair, Evan McDonald, Vincenzo Macri, Kristin Zahynacz, Valerie E. Walker, Eric A. Accili

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMichael Smith Health Research BCUniversity of British ColumbiaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésER retentionCyclic nucleotide-binding domainEndoplasmic reticulumCell biologyHCN channelBiophysicsNucleotideHyperpolarization (physics)ChemistryHEK 293 cellsIon channelBiologyBiochemistryStereochemistryGeneReceptorNuclear magnetic resonance spectroscopy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have suggested that a portion of the cyclic nucleotide-binding domain (CNBD) of the hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2 (HCN2) "pacemaker" channel, composed of the A- and B-helices and the interceding beta-barrel, confers two functions: inhibition of channel opening in response to hyperpolarization and promotion of cell surface expression. The sequence determinants required for each of these functions are unknown. In addition, the mechanism underlying plasma membrane targeting by this subdomain has been limitedly explored. Here we identify a four-amino acid motif (EEYP) in the B-helix that strongly promotes channel export from the endoplasmic reticulum (ER) and cell surface expression but does not contribute to the inhibition of channel opening. This motif augments a step in the trafficking pathway and/or the efficiency of correct folding and assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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