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Enregistrement W2145489010 · doi:10.1242/jeb.002568

Rhesus glycoprotein gene expression in the mangrove killifish<i>Kryptolebias marmoratus</i>exposed to elevated environmental ammonia levels and air

2007· article· en· W2145489010 sur OpenAlexaff
C. Y. C. Hung, Kim Tsui, Jonathan M. Wilson, C. Michele Nawata, Chris M. Wood, Patricia A. Wright

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKillifishBiologyGillExcretionGeneFundulusTambaquiAmmoniaGene expressionMolecular biologyCell biologyBiochemistryFish <Actinopterygii>Fishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanism(s) of ammonia excretion in the presence of elevated external ammonia are not well understood in fish. Recent studies in other organisms have revealed a new class of ammonia transporters, Rhesus glycoprotein genes (Rh genes), which may also play a role in ammonia excretion in fish. The first objective of this study was to clone and characterize Rh genes in a fish species with a relatively high tolerance to environmental ammonia, the mangrove killifish Kryptolebias marmoratus (formerly Rivulus marmoratus). We obtained full-length cDNAs of three Rh genes in K. marmoratus: RhBG (1736 bp), RhCG1 (1920 bp) and RhCG2 (2021 bp), which are highly homologous with other known Rh gene sequences. Hydropathy analysis revealed that all three Rh genes encode membrane proteins with 10-12 predicted transmembrane domains. RhBG, RhCG1 and RhCG2 are highly expressed in gill tissue, with RhBG also present in skin of K. marmoratus. Exposure to elevated environmental ammonia (2 mmol l(-1) NH(4)HCO(3)) for 5 days resulted in a modest (+37%) increase in whole-body ammonia levels, whereas gill RhCG2 and skin RhCG1 mRNA levels were upregulated by 5.8- and 7.7-fold, respectively. RhBG mRNA levels were also increased in various tissues, with 3- to 7-fold increases in the liver and skeletal muscle. In a separate group of killifish exposed to air for 24 h, RhCG1 and RhCG2 mRNA levels were elevated by 4- to 6-fold in the skin. Thus, the multifold induction of Rh mRNA levels in excretory tissues (gills and skin) and internal tissues in response to conditions that perturb normal ammonia excretion suggests that RhBG, RhCG1 and RhCG2 may be involved in facilitating ammonia transport in this species. Furthermore, the findings support earlier studies demonstrating that the skin is an important site of ammonia excretion in K. marmoratus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,082
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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