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Enregistrement W2145548367 · doi:10.1186/2049-2618-2-24

Effect of chemotherapy on the microbiota and metabolome of human milk, a case report

2014· article· en· W2145548367 sur OpenAlexafffund
Camilla Urbaniak, Amy McMillan, Michelle Angelini, Gregory B. Gloor, Mark W. Sumarah, Jeremy P. Burton, Gregor Reid

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaLondon Health Sciences CentreLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMetabolomeBiologyBifidobacteriumGut floraAntibioticsEubacteriumPhysiologyMicrobiologyFood scienceImmunologyMetabolomicsBacteriaLactobacillusBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human milk is an important source of bacteria for the developing infant and has been shown to influence the bacterial composition of the neonatal gut, which in turn can affect disease risk later in life. Human milk is also an important source of nutrients, influencing bacterial composition but also directly affecting the host. While recent studies have emphasized the adverse effects of antibiotic therapy on the infant microbiota, the effects of maternal chemotherapy have not been previously studied. Here we report the effects of drug administration on the microbiota and metabolome of human milk. METHODS: Mature milk was collected every two weeks over a four month period from a lactating woman undergoing chemotherapy for Hodgkin's lymphoma. Mature milk was also collected from healthy lactating women for comparison. Microbial profiles were analyzed by 16S sequencing and the metabolome by gas chromatography-mass spectrometry. FINDINGS: Chemotherapy caused a significant deviation from a healthy microbial and metabolomic profile, with depletion of genera Bifidobacterium, Eubacterium, Staphylococcus and Cloacibacterium in favor of Acinetobacter, Xanthomonadaceae and Stenotrophomonas. The metabolites docosahexaenoic acid and inositol known for their beneficial effects were also decreased. CONCLUSION: With milk contents being critical for shaping infant immunity and development, consideration needs to be given to the impact of drugs administered to the mother and the long-term potential consequences for the health of the infant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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