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Enregistrement W2145578897 · doi:10.1182/blood-2003-12-4286

A novel type 2A von Willebrand factor mutation located at the last nucleotide of exon 26 (3538G>A) causes skipping of 2 nonadjacent exons

2004· article· en· W2145578897 sur OpenAlexaff
Paula James, Lee A. O’Brien, Carol Hegadorn, Colleen Notley, Gary Sinclair, Christine Hough, Man‐Chiu Poon, David Lillicrap

Notice bibliographique

RevueBlood · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonMolecular biologyMutationTransition (genetics)Missense mutationComplementary DNABiologyRecombinant DNAExon skippingExon trappingPoint mutationVon Willebrand diseaseGeneticsVon Willebrand factorCoding regionChemistryGeneAlternative splicingPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this manuscript, we describe a case of type 2A von Willebrand disease (VWD) caused by the novel heterozygous G>A transition at nucleotide 3538, which should result in the putative, nonconservative substitution of G1180R. This mutation was reproduced by site-directed mutagenesis; however, the recombinant mutant protein was efficiently secreted from cells and assembled correctly into multimers. Because the substitution is located at the last nucleotide of exon 26, the patient's platelet von Willebrand factor (VWF) mRNA was analyzed and 3 transcripts were observed: the normal transcript without the 3538G>A transition, a transcript with the in-frame deletion of exon 26, and a transcript with the in-frame deletions of exons 23 and 26. These deletion VWF cDNA constructs were created and the resulting recombinant proteins were analyzed following transfection into COS-7 cells. Cotransfection results demonstrate that the exon-skipped transcripts led to intracellular retention, and the levels of VWF antigen (VWF:Ag) produced by these constructs were as follows: del23/26 A transition at nucleotide (nt) 3538 does not result in the expression of the G1180R missense mutation, but rather leads to exon skipping, which is the pathogenic basis of the patient's phenotype. This is the first report of a coding region mutation resulting in the skipping of 2 nonadjacent exons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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