Quadrupolar central transition (QCT) and <sup>13</sup>C NMR competition studies of metal ion binding to ovotransferrin
Notice bibliographique
Résumé
The transferrins are a family of relatively large bilobal proteins that play a major role in the transport of Fe3+, as well as several other physiological and nonphysiological metal ions. Transferrins can also act as antimicrobial agents, by tightly sequestering iron and making it unavailable for bacterial growth. Using a combination of quadrupolar central transition (QCT) metal ion NMR (27Al, 45Sc, 51V, and 71Ga) and 13C NMR, the binding and displacement of a variety of metal ions to ovotransferrin was studied through direct metal ion competition experiments. The metal ions investigated (Al3+, Co3+, Fe3+, Ga3+, In3+, Sc3+, Y3+, and VO2+) were of differing ionic radius and charge, thus allowing for an assessment of how these factors contribute to metal ion affinity. The competition for the N- and C-terminal metal ion binding sites on ovotransferrin was directly followed by metal ion QCT NMR. Moreover, 13C NMR was used to study the two protein-bound synergistic anions (13C-labeled carbonate), whose chemical shifts are distinct and dependent on the bound metal ion that is present in the binding sites. The observed order of decreasing affinity for the metal ions studied was Fe3+ ≈ In3+ ≥ Sc3+ ≥ Ga3+ > Al3+ > VO2+ > Y3+ ≥ Co3+. These results illustrate how a combination of multinuclear solution NMR methods can provide unique insights into the ligand binding properties of larger metalloproteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».