Quantification of the arbuscular mycorrhizal fungus <i> Glomus intraradices</i> in host tissue using real‐time polymerase chain reaction
Notice bibliographique
Résumé
• A rapid method to quantify the colonization of the arbuscular mycorrhizal fungus (AMF) Glomus intraradices in planta using quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) technique. • Specific PCR primers for the fungus (28S rDNA sequence) and host root tissue (chitinase and chalcone synthase gene) were developed and their respective specificity determined. • The plant specific primers for Lycopersicon esculentum, Medicago truncatula amplified linearly over a concentration range of: 6.4 pg to 20 ng. The G. intraradices-specific primer amplified as low as 1 pg of its target DNA, which allowed us to detect a single spore of the fungus. High degrees of correlation were obtained when threshold cycle (Ct) was plotted against vesicular, hyphal and total colonization using microscopically quantified host roots. • This is the first report of the application of the qRT-PCR technique for quantification of AMF colonization in planta. The success of its application should open up the possibility of its wider application in AM research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».