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Enregistrement W2145697300 · doi:10.1002/bit.25339

Development of a soft‐sensor based on multi‐wavelength fluorescence spectroscopy and a dynamic metabolic model for monitoring mammalian cell cultures

2014· article· en· W2145697300 sur OpenAlexaff
Kaveh Ohadi, Raymond L. Legge, Hector Budman

Notice bibliographique

RevueBiotechnology and Bioengineering · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSoft sensorExtended Kalman filterBiological systemKalman filterChinese hamster ovary cellComputer scienceSampling (signal processing)ChemistryProcess (computing)Filter (signal processing)Artificial intelligenceBiologyBiochemistryComputer vision

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A soft-sensor based on an Extended Kalman Filter (EKF) that combines data obtained using a fluorescence-based soft-sensor with a dynamic mechanistic model, was investigated as a tool for continuous monitoring of a Chinese hamster ovary (CHO) cell cultivation process. A standalone fluorescence based soft-sensor, which uses a combination of an empirical multivariate statistical model and measured spectra, was designed for predicting key culture variables including viable and dead cells, recombinant protein, glucose, and ammonia concentrations. The standalone fluorescence sensor was then combined with a dynamic mechanistic model within an EKF framework, for improving the prediction accuracy and generating predictions in-between sampling instances. The dynamic model used for the EKF framework was based on a structured metabolic flux analysis and mass balances. In order to calibrate the fluorescence-based empirical model and the dynamic mechanistic model, cells were grown in batch mode with different initial glucose and glutamine concentrations. To mitigate the uncertainty associated with the model structure and parameters, non-stationary disturbances were accounted for in the EKF by parameter-adaptation. It was demonstrated that the implementation of the EKF along with the dynamic model could improve the accuracy of the fluorescence-based predictions at the sampling instances. Additionally, it was shown that the major advantage of the EKF-based soft-sensor, compared to the standalone fluorescence-based counterpart, was its capability to track the temporal evolution of key process variables between measurement instances obtained by the fluorescence-based soft-sensor. This is crucial for designing control strategies of CHO cell cultures with the aim of guaranteeing product quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,278
Score d'incertitude au seuil0,573

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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