Converging pathways involving microRNA-206 and the RNA-binding protein KSRP control post-transcriptionally utrophin A expression in skeletal muscle
Notice bibliographique
Résumé
Several reports have previously highlighted the potential role of miR-206 in the post-transcriptional downregulation of utrophin A in cultured cells. Along those lines, we recently identified K-homology splicing regulator protein (KSRP) as an important negative regulator in the post-transcriptional control of utrophin A in skeletal muscle. We sought to determine whether these two pathways act together to downregulate utrophin A expression in skeletal muscle. Surprisingly, we discovered that miR-206 overexpression in cultured cells and dystrophic muscle fibers causes upregulation of endogenous utrophin A levels. We further show that this upregulation of utrophin A results from the binding of miR-206 to conserved sites located in the 3'-UTR (untranslated region) of KSRP, thus causing the subsequent inhibition of KSRP expression. This miR-206-mediated decrease in KSRP levels leads, in turn, to an increase in the expression of utrophin A due to a reduction in the activity of this destabilizing RNA-binding protein. Our work shows that miR-206 can oscillate between direct repression of utrophin A expression via its 3'-UTR and activation of its expression through decreased availability of KSRP and interactions with AU-rich elements located within the 3'-UTR of utrophin A. Our study thus reveals that two apparent negative post-transcriptional pathways can act distinctively as molecular switches causing repression or activation of utrophin A expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».