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Enregistrement W2145788892 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-03-0545

Demethylation of Urokinase Promoter as a Prognostic Marker in Patients with Breast Carcinoma

2004· article· en· W2145788892 sur OpenAlexaff
Pouya Pakneshan, Bernard Têtu, Shafaat A. Rabbani

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité LavalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMethylationCancer researchEpigeneticsBiologyDNA methylationPromoterEstrogen receptorCancerBisulfite sequencingGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Urokinase (uPA) is expressed in a number of highly invasive malignancies including breast cancer. Because production of uPA is associated with breast cancer progression and can serve as a useful prognostic marker, the purpose of this study was to examine the role of uPA promoter methylation as an indicator of uPA production in breast cancer patients. EXPERIMENTAL DESIGN: We examined the methylation status of the uPA promoter and the levels of uPA expression in normal human breast epithelial cells and several human breast cancer cells by bisulfite sequencing analysis and reverse transcription-PCR. We also analyzed the methylation status of the uPA promoter in surgical biopsy samples from patients with breast cancer of different grades, as determined by the Elston-Ellis histological grading system. RESULTS: Expression of uPA mRNA was only detected in the highly invasive estrogen receptor-negative breast cancer cell lines, where the promoter was completely demethylated. In normal and low invasive breast cancer cells, the uPA promoter was methylated, resulting in lack of uPA mRNA expression. Analysis of biopsy samples showed that demethylation of the uPA promoter is associated with malignant transformation. Reverse transcription-PCR analysis revealed that this demethylation of the uPA promoter is directly associated with induction of uPA mRNA expression, which is well known to be associated with poor prognosis in breast cancer patients. CONCLUSIONS: This study indicated that uPA expression in breast cancer patients is under epigenetic control via methylation of its promoter. Determination of uPA promoter methylation can therefore serve as an early reliable indicator of uPA production in breast cancer patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,293

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,363 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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