A Metabolomic Study Reveals Novel Plasma Lyso-Gb3 Analogs As Fabry Disease Biomarkers
Notice bibliographique
Résumé
Fabry disease is an X-linked, multisystemic lysosomal storage disorder due to alpha-galactosidase A deficiency. It is characterized by the accumulation of glycosphingolipids, mainly globotriaosylceramide (Gb(3)), in biological fluids, vascular endothelium, heart, and kidneys. Treatment by enzyme replacement therapy has been shown to be beneficial in both males and females affected with the disease. In addition to Gb(3), increased concentrations of globotriaosylsphingosine (lyso-Gb(3)) have recently been reported in urine and plasma of Fabry patients. The overall objective of this metabolomic study was to identify and characterize new potential plasma biomarkers in treated and untreated males and females affected with Fabry disease which might better reflect disease severity and progression. We employed a time-of-flight mass spectrometry metabolomic approach using plasma samples of Fabry patients compared to age-matched controls. We found three new lyso-Gb(3) analogs in Fabry patients presenting m/z ratios at 802, 804, and 820. As previously detected by our group, we also found a m/z ratio of 784 corresponding to the lyso-Gb(3) molecule minus two hydrogen atoms. Using exact mass measurements and tandem mass spectrometry, we confirmed that these analogs result from modifications of the lyso-Gb(3) sphingosine moiety. We evaluated the relative plasma concentration by measuring area counts for each lyso-Gb(3) analog. None of these analogs was detected in the majority of healthy controls. The relative concentration of each analog was higher in males compared to female Fabry patients. We demonstrated that mass spectrometry combined to a metabolomic approach is a powerful tool to detect and identify new potential biomarkers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».