MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2145846724 · doi:10.1128/jcm.01424-08

Multilocus Sequence Types Associated with Neonatal Group B Streptococcal Sepsis and Meningitis in Canada

2009· article· en· W2145846724 sur OpenAlexfundaboutno aff
Shannon D. Manning, A. Cody Springman, Erica Lehotzky, Maggi A. Lewis, Thomas S. Whittam, H. Dele Davies

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal and Maternal Infections
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthUniversity of CalgaryMichigan State University
Mots-clésMeningitisMultilocus sequence typingStreptococcus agalactiaeNeonatal sepsisGroup BNeonatal meningitisSepsisSequence (biology)MicrobiologyStreptococcaceaeBiologyGroup AMedicineStreptococcusImmunologyGeneticsBacteriaPediatricsInternal medicineAntibioticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Group B streptococci (GBS), a leading cause of neonatal sepsis and meningitis, are transferred to neonates from colonized mothers during childbirth. Prior studies using multilocus sequence typing (MLST) have found specific GBS clones (e.g., sequence type 17 [ST-17]) to be associated with neonatal disease in several geographic locations. Few population-based studies, however, have been conducted to determine the frequency of disease caused by specific GBS clones. MLST was used to assess the genetic diversity of 192 GBS strains from neonates and young children identified by population-based surveillance in Alberta, Canada, from 1993 to 2002. Comparisons were made to 232 GBS strains collected from colonized pregnant women, and all strains were characterized for one of nine capsule (cps) genotypes. A total of 47 STs were identified, and more than 80% of GBS strains were represented by 7 STs that have been shown to predominate in other populations. ST-17 and ST-19 were more prevalent in strains causing early onset disease (EOD) and late onset disease (LOD) than from pregnant women, whereas STs 1, 12, and 23 were more common in pregnant women. In addition, ST-17 strains and close relatives more frequently caused meningitis than sepsis and LOD versus EOD in this population of neonates. Further research is required to better understand why strains belonging to the ST-17 phylogenetic lineage are more likely to cause both LOD and meningitis and may provide clues into the pathogenesis of these conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,005
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations188
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical MicrobiologyMême sujetNeonatal and Maternal InfectionsTravaux en français237 207