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Enregistrement W2145883032 · doi:10.1002/bmb.20233

<i>Caenorhabditis elegans</i>as an undergraduate educational tool for teaching RNAi

2008· article· en· W2145883032 sur OpenAlexaff
Janet Andersen, Alexander Krichevsky, Joerg R. Leheste, Daniel J. Moloney

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Molecular Biology Education · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensNew York Institute of Technology
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCaenorhabditis elegansRNA interferenceBiologyComputational biologyMathematics educationPsychologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Discovery of RNA-mediated interference (RNAi) is widely recognized as one of the most significant molecular biology breakthroughs in the past 10 years. There is a need for science educators to develop teaching tools and laboratory activities that demonstrate the power of this new technology and help students to better understand the RNAi process. C. elegans is an ideal model organism for the undergraduate laboratory because of the simplicity of worm maintenance, its well-studied genetic background, and the fact that it can be employed as a model organism in laboratory environments where vertebrate research is restricted. Certain unique features of C. elegans make it a very suitable organism for RNAi studies. Specifically, nematode strains highly sensitive to RNAi are readily available from public sources, and RNAi induction by a feeding method is an uncomplicated procedure that lends itself readily as an educational tool. In this article, we provide a detailed depiction of the use of C. elegans as an RNAi educational tool, describing two separate RNAi-based experiments. One is a qualitative experiment where students can examine the effects of knocking down the unc-22 gene involved in the regulation of muscle contraction, which results in a "twitching" phenotype. The other experiment is a quantitative RNAi experiment, where students measure the effect of knocking down the lsy-2 gene involved in neuronal development. Although these experiments are designed for a college-level study, nematode research projects can also be accomplished in secondary school facilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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